EMDR, özellikle travmatik deneyimlerin neden olduğu olumsuz duyguları azaltmada oldukça etkilidir. Travma sonrası yaşanan olayların beyinde işlenme süreci, EMDR ile yeniden düzenlenir. Örneğin, bireyin geçmişte yaşadığı ve hâlâ kaygı yaratan bir olay üzerinde çalışılırken, terapistin yönlendirmesiyle göz hareketleri yapılır. Bu süreç, beynin olumsuz deneyimleri daha sağlıklı bir biçimde işlemesine yardımcı olur, böylece kişi geçmişin izlerinden özgürleşir. EMDR, anksiyete, fobiler ve travma sonrası stres bozukluğu gibi birçok sorunda olumlu sonuçlar verir.